目前，口腔医学院下设六个教研室，分别为口腔基础医学教研室、牙体牙髓病学教研室、口腔修复学教研室、口腔正畸学教研室、口腔颌面外科学教研室、口腔黏膜病学教研室。
其中，口腔基础医学教研室承担《口腔组织病理学》《口腔解剖生理学》《口腔预防医学》课程的教学工作，牙体牙髓病学教研室承担《牙体牙髓病学》《口腔诊所经营管理》课程的教学工作，口腔修复学教研室承担《口腔修复学》《口腔医学导论》课程的教学工作，口腔正畸学教研室承担《口腔正畸学》《牙周病学》《儿童口腔医学》课程的教学工作，口腔颌面外科学教研室承担《口腔颌面外科学》《口腔颌面医学影像诊断学》《口腔材料学》《口腔生物学》《口腔种植学》课程的教学工作，口腔黏膜病学教研室承担《口腔黏膜病学》课程的教学工作。
口腔临床实践教学中心使用面积999平方米，总教学实验仪器设备558台（件）仪器设备总值822.30（万元）。口腔临床实践教学中心下设实验室，包括：口腔综合实验室、口腔仿真头模实验室、口腔修复学实验室、口腔组织病理学实验室、口腔解剖生理学实验室、口腔综合考评实训室、口腔实验准备室，共计12间。主要实验设备包括：牙科综合治疗机17台、口腔仿头模71台、口腔技工台68台。含有口腔集中供气系统、口腔迪凯尔口腔技能培训及实时评估系统、数码互动教室系统、烤瓷炉、喷砂机、真空搅拌机、洁牙机、根管显微镜、热牙胶充填系统等现代化教学实验设备。
专业现有教学基地6所，包括附属口腔医院（沈阳市口腔医院）、附属中心医院、附属第二医院及口腔专科医院3所。其中，附属口腔医院为三级口腔专科医院、国家级住院医师规范化培训主基地。各基地依托区域影响力与专科优势，病源类型丰富，涵盖口腔医学各领域，能充分满足实习生多样化临床实践需求。
各基地设立专门机构、配备专职人员管理临床教学，教学资源充足，可完成大纲规定实习任务，满足学生临床实践培养需求。
